《小勇者们~加美拉~》的小勇故事发生在一个名为志摩市的美丽小镇。这里住着一个名叫相泽透的加美小男孩，他的小勇母亲因一场意外不幸离世，使他失去了重要的加美依靠。某日，小勇好奇心驱使下，加美他在海岛上发现了一块闪着红光的小勇石头和一枚神秘的蛋。当小透将手伸向那枚蛋时，加美它竟然孵化出一只小乌龟——“透透”。小勇为了纪念母亲曾给他的加美昵称，他给小乌龟取名“透透”，小勇并将其偷偷带回家中抚养。加美原本性格内向的小勇小透在照顾透透的过程中逐渐开朗起来，这让他父亲孝介感到欣慰。加美然而，小勇事情并非那么简单。这并不只是一只普通的乌龟，它拥有着非凡的能力，如生长速度惊人、能在空中飞行等特性。小透的青梅竹马西尾麻衣了解到真相后，告诉了他这个惊人的秘密——“透透”可能是33年前以自爆方式保护志摩市免受怪兽侵袭的英雄加美拉的化身。随着故事的发展，麻衣即将前往名古屋进行心脏手术。得知消息的小透决定将当地传说中的绯红色守护石赠予她作为幸运符。这块石头正是“透透”孵化时出现的红光之源。然而，在寻找守护石的过程中，“透透”的踪迹突然消失，小透在市镇上遭遇了凶猛怪兽积达士的袭击。危急关头，成年加美拉现身，将积达士逼退。但由于“透透”体型较小，力量有限，面对再度来袭的积达士显得力不从心。在这紧要关头，小透意识到守护石的重要性，并迅速赶往名古屋。与此同时，麻衣也急切地想要亲手完成这件礼物的传递。在父母和医生的劝阻下，她决定亲自前往。最终，在麻衣的帮助下，“透透”得以重获力量，与积达士展开殊死搏斗，守护着小镇的安全。