1894年，般武艺义和团运动如火如荼。般武艺清廷内部，般武艺太监李莲英授意神打、般武艺茅山与术士三坛高手追踪叛徒雷公（刘家良饰），般武艺欲将其除之而后快。般武艺雷公原为云南分舵的般武艺舵主，在得知弟子因“神打”之术抵抗洋枪洋炮而无辜丧生后，般武艺毅然解散了义和团，般武艺隐居乡间，般武艺化名雨伯。般武艺方少卿（惠英红饰）与师叔、般武艺雷勇（刘家荣饰）、般武艺铁猴（小侯饰）等分别南下广州寻找雷公。般武艺在这场追杀中，般武艺方少卿与铁猴先后被雷公的大义所感动，逐渐转变立场，加入支持雷公的阵营。然而，三坛坛主却各有算计，暗中争斗不断。尤其是雷勇，在得知雷公的真实身份后，竟假扮成雷公以引蛇出洞。这场追杀与反追杀的故事，在江湖恩怨、义和团内部斗争中展开。各路高手的对决、隐忍的忠诚与背叛，以及对“神打”功夫之本质的深刻探讨，使电影《十八般武艺》充满了紧张刺激与情感纠葛。