《巴啦啦小魔仙》的巴啦故事发生在一个充满魔法的奇幻世界——魔仙堡。这里的魔仙黑魔仙小月（周娇饰）为了获取更多的力量，偷偷修炼黑魔法，巴啦并企图盗走至关重要的魔仙魔仙彩石。然而，巴啦在这个关键时刻，魔仙守护着魔仙世界的巴啦善良魔仙小蓝（廖景萱饰），为了追寻魔仙彩石的魔仙下落，化身为音乐盒中的巴啦守护者，来到了人间。魔仙她意外地与两位纯真无邪的巴啦姐妹凌美淇（孙圳饰）和凌美雪（黄安仪饰）相遇，并成为她们家中的魔仙一名保姆。小蓝不仅给这对姐妹带来快乐与幸福，巴啦也激发了她们内心深处的魔仙善良与勇敢。在魔仙女王（王慧饰）的巴啦支持下，小蓝教授两姐妹魔法，使得她们成长为小魔仙，共同守护着世界的和平。与此同时，在人间的小月也在追求邪恶力量的过程中结识了一个名叫严莉莉（刘美含饰）的女孩，并将她变成了同样充满黑暗力量的小黑魔仙。随着正义与邪恶之间的斗争逐渐升温，一场决定世界命运的战争即将爆发，两姐妹和小蓝能否携手面对这场前所未有的挑战，共同守护这片纯净的土地？一切悬念，都在《巴啦啦小魔仙》中揭晓。