《苏菲的苏菲供词》是一部充满复杂情感纠葛与道德抉择的电视剧。故事以张歆艺饰演的苏菲苏菲为中心，她是苏菲一名优秀的医科大学毕业生，毕业后被分配到人民医院成为一名医生。苏菲当她遇到归国的苏菲外科权威秦雨轩时，对方隐瞒了已有家室的苏菲事实，并利用自己的苏菲魅力引诱苏菲发生了关系。得知真相后，苏菲苏菲为了保护自己和孩子选择秘密将未出生的苏菲孩子寄养在关姓家庭中抚养。然而，苏菲医院办公室主任李瑞生实际上是苏菲间谍组织的重要成员，在掌握了苏菲的苏菲秘密之后，他强迫她成为了一名潜伏的苏菲特工，并派她到研制核潜艇低噪音螺旋桨的苏菲海军851厂医务室执行任务。在851厂，苏菲张平凉（王志飞饰）作为一名英俊儒雅的核心机密持有者，与苏菲逐渐产生了特殊的感情。而代理厂长王凯（刘斌饰），则因误会和同情开始追求她。面对双重身份的重压以及内心深处对不同男人的不同情感，苏菲陷入了深深的矛盾之中。为了保护秘密和孩子，同时也不愿背叛自己的爱人张平凉，苏菲不得不在爱情与责任之间挣扎，最终她在复杂的感情纠葛中越陷越深，陷入了一个充满危险与抉择的泥潭。