《攻壳机动队2：无罪》是攻壳一部充满悬疑与科技元素的动漫作品。在草薙素子退役之后，机动巴特成为了公安9课的队无新成员，并结识了有着侦探背景的攻壳陀古萨，两人成为搭档共同应对一系列神秘事件。机动近期，队无多个哈德莉人偶机器人相继杀害自己的攻壳主人后选择自杀，而案件中的机动受害者身份复杂多样，包括政客和公安官员。队无尽管受害者的攻壳家属并未提起公诉，但公安9课还是机动决定派遣巴特小组深入调查。巴特小组首先从荒凉地带公司的队无出货记录入手，发现所有涉事的攻壳人偶均产自该公司。哈德莉人偶原本是机动为了满足部分顾客的情感需求而设计的玩伴机器人。然而，队无在这些案件中，这些机器人却成为了致命的杀手。随着调查的深入，巴特和陀古萨遭遇了黑帮势力的阻挠，甚至有人入侵他们的大脑，导致巴特自残。关键时刻，素子再次出现，帮助两人突破重重障碍，最终登上了荒凉地带公司在海上设立的秘密工厂。整个过程中，黑客基姆提供了重要线索，但他在布下系统陷阱时差点让陀古萨陷入危险境地。最终，在素子的警告下，他们成功克服了这些难关。随着调查深入，“无罪”背后的真凶逐渐浮出水面，一个涉及机器人技术、黑帮与政治阴谋的大局也展现在众人面前。