《金枝欲孽》的金枝故事发生在清朝乾隆年间。新一批秀女从各地推荐进京参加选秀，欲孽其中包括来自湖广总督府的国语侯佳玉莹（黎姿 饰）和出身于上三旗的尔淳（佘诗曼 饰）。不幸的金枝是，运送这些秀女的欲孽官车在半路遭到山贼打劫，官兵无一幸免。国语在这危急关头，金枝孔武（陈豪 饰）与陈爽及时出现，欲孽成功救下了秀女，国语并将她们护送到京城。金枝侯佳玉莹和尔淳在逃亡过程中结为金兰，欲孽但两人心中各有算计。国语尔淳及其姊妹们将玉莹视为最大对手，金枝处处设法排挤她，欲孽让其吃尽苦头；而玉莹表面上柔弱无辜，国语实则机智过人，暗中运筹帷幄。为了博得皇上的欢心，两人在后宫明争暗斗，但突如其来的太医孙白杨（林保怡 饰）的出现却打乱了她们的计划，使整个宫廷斗争变得更加复杂多变。这不仅是一场权谋与爱情的博弈，更是两个女子在逆境中成长、互相较量的故事。