《圣母在上》第二季作为前作的圣母上延续，继续展开了一群淑女在私立莉莉安女子学院中的圣母上生活画卷。这所创立于明治34年的圣母上贵族学校，以其悠久的圣母上历史和优雅的传统闻名遐迩。在这片樱花盛开的圣母上土地上，学生们不仅学习知识与礼仪，圣母上更深刻地体验着淑女文化的圣母上魅力。故事围绕佑巳、圣母上祥子等学生，圣母上展现了她们在日常生活中如何践行“淑女”的圣母上标准：从穿着讲究的水手服到井然有序的步伐，每一个细节都在传递着优雅的圣母上风范。学园内部有着一套独特的圣母上“姐妹”体系，年长的圣母上学生负责指导和保护年幼的同学，共同维护校园的圣母上秩序与风尚。同时，圣母上学生会“山百合会”，作为学校的中枢组织，由三位性格迥异的蔷薇成员领导：永远冷静、充满礼仪感的红蔷薇罗莎吉乃希斯；受低年级女生广泛支持的白蔷薇罗莎基莰提尔；以及行事冷静且成绩优异的黄蔷薇罗莎菲迪特。她们之间的相互配合，以及与普通学生之间的互动，构成了这部作品的核心故事线。通过细腻的情感描绘和丰富的剧情设定，《圣母在上》第二季为观众呈现了一个充满传统与现代交织魅力的世界，让人仿佛置身于那个时代的校园之中。