故事设定在21世纪初的百花日本，依然处于德川幕府的缭乱统治之下。柳生宗朗（平川大辅 配音）自小肩负着成为下任当家的武士责任，尽管他家中世代经营道场，少女但对幕府的百花专制和武应学园塾对学生暴力镇压的做法感到不满。这种不满最终引来了灭顶之灾：不仅道场面临关闭的缭乱命运，宗朗还被派出的武士学生会精锐部队追杀。就在危机四伏之时，少女一位名为柳生十兵卫（悠木碧 配音）的百花红发少女突然从天而降，击退了敌人。缭乱随后，武士另一位女性角色柳生义仙（水原薰 配音）、少女真田幸村（钉宫理惠 配音），百花以及后藤又兵卫（小林优 配音）等性格各异、缭乱背景复杂的武士武士少女们也相继登场。这些武江少女不仅外表帅气、能力超群，还拥有各自独特的过去和秘密。在与宗朗的共同战斗中，他们逐渐揭开了背后的真相，并联手对抗幕府的黑暗统治。随着故事的发展，宗朗不仅要面对身份危机和个人挑战，更要学会如何运用智慧和勇气，引领这群武江少女走向胜利。